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Biocomputación, IA y Capital Q.

Agosto 2026bio-iaglass-boxauditoría

Dónde gana la termodinámica: un contraste de régimen

Auditamos nuestro propio pipeline: el canal termodinámico no añade valor en missense (AUC +0.000 sobre la señal evolutiva, que ya da ~0.90), pero clasifica variantes sinónimas (AUC 0.63–0.71), donde el modelo de lenguaje de proteína es ciego. Corregir el propio registro como producto.

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Julio 2026bio-iaglass-boxherramienta

El clasificador sinónimo cabe en dos variables físicas

La CNN sinónima se reduce a dos observables físicos interpretables — el ΔΔG de apilamiento con signo (Turner) + el sesgo G>A — que quedan a la par en la comparación pareada gen a gen (AUC 0,671 vs 0,659) y generalizan entre genes. Glass-box, desplegable como pip install ef-synonymous + herramienta web gratuita.

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Julio 2026bio-iabenchmarkTECH-2

Benchmark: EnergyFingerprint vs CADD, REVEL, AlphaMissense

Comparativa formal en 7 genes con meta-análisis estratificado. EF alcanza ΔAUC de −0,024 a −0,040 frente a predictores masivos — queda por debajo de los tres en conjunto, y supera a CADD en el canal de sodio SCN1A (0,913 vs 0,832). Que la señal sea ortogonal y aditiva es una hipótesis por probar.

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Junio 2026bio-iapaper

EnergyFingerprint: clasificación de variantes missense con perfiles termodinámicos

CNN 1D multicanal que combina la energía libre de apilamiento del mRNA con señal evolutiva de ESMC-300M. 8 genes en el preprint, AUC intra-gen hasta 0,99; panel de 42 genes con resultados no publicados. Transferibilidad zero-shot entre familias de proteínas.

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Mayo 2026bio-iapaper

Optimización de mRNA terapéutico: el eje termodinámico que LinearDesign no usa

El perfil ΔG de apilamiento aporta una dimensión propia frente a la estructura secundaria (78 % de su varianza no es ni composición ni apareamiento). Optimizador dual: prueba de concepto computacional que obtiene valores de ΔG y MFE más favorables que BNT162b2 y mRNA-1273, sin validación experimental.

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Mayo 2026bio-iapapertrilogía

Variantes sinónimas patogénicas: la señal termodinámica que REVEL no ve

Las variantes sinónimas no cambian la proteína pero sí el perfil termodinámico del mRNA. Un predictor CNN con señal termodinámica pura: AUC 0,683 ± 0,018, sin superar a SpliceAI. Marco conceptual Λ = S ⊗ Φ.

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// líneas colaterales · exploración del laboratorio
Julio 2026 · colateral
colateralcapital_q

Capital Q: la energía que se transforma en conocimiento

Un modelo de empresa donde la unidad de capital no es la hora de trabajo ni el activo físico, sino el token: el cómputo de inferencia que, gobernado y capturado, se acumula como conocimiento propio y defendible.

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Julio 2026 · colateral
colateralagent-boardgobernanza

Agent Board: gobernanza fail-closed para agentes de IA

Un tablero Kanban donde varios agentes colaboran bajo supervisión humana: broker de aprobación fail-closed, auditoría hash-chain, RBAC y adaptador multi-LLM. Nació como banco de pruebas de los pipelines del laboratorio.

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Julio 2026 · colateral
colateralagent-canvasdiseño

Agent Canvas Model: diseñar el agente antes de programarlo

Una adaptación del Business Model Canvas a nueve bloques para forzar las decisiones caras —segmento, autonomía, KPIs, integraciones, costes, riesgos— antes de escribir una línea de código.

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